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生物軟件網>>>>序列綜合分析軟件>>>>K-Estimator 6.1v

K-Estimator 6.1v

   

軟件大。 5,089K
軟件語言: 英文
軟件類別: 序列綜合分析軟件類
運行環境: Win9x/Me/NT/2000/XP/2003
加入時間: 2013-09-05
原始網站: Home Page

詳細介紹

K-Estimator is a program to estimate the number of synonymous (Ks) and nonsynonymous substitutions (Ka) per site and the confidence intervals by Monte Carlo simulations.

當對兩個核酸序列進行比對時,K-Estimator用來評估兩者核苷酸替代數(趨異性),包括蛋白編碼區與非蛋白編碼區。使用Monte Carlo模擬估算可信區間。在分子進化研究中,評估兩條核酸序列的被替換核苷酸數量是一個中心課題。精確量化這些數據將直接影響廣泛應用于進化基因學的許多實驗的可靠性。對蛋白編碼區,分為兩種情況,一種是核苷酸替換不造成氨基酸改變,稱為同義替代(synonymous),另一種情況為核苷酸替換造成氨基酸改變,稱為非同義替代(nonsynonymous),必須分別評估這種核苷酸替代數量。每個位點同義替代數量用Ks表示,非同義替代數量用Ka表示。對非蛋白編碼區,總替代數為K。K-Estimator 便是用來計算K.Ka,Ks及可信區間的應用軟件。

 

 

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