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RNA分析類

           
RNA draw 1.1 b2 RNA draw 1.1b2 RNA二級結構分析軟件。
RNAstructure 5.7 Unix平臺軟件mfold的java版本。
RnaViz 2.0 界面友好的RNA二級結構圖繪制程序?缮砂l表質量的二級結構圖,可顯示一些特殊結構。
loopDloop 2.07b Java語言寫成的繪制RNA二級結構的軟件,需要安裝JAVA虛擬機。
Circles 0.1.1 使用比較的方法分析RNA二級結構軟件,并以標準格式輸出預測的二級結構。
SStructView 1.2 用JAVA腳本語言寫成的RNA二級結構顯示軟件。
Vienna RNA Package 2.1.9 維也納大學RNA二級結構預測與比較軟件包。
XRNA 1.2.0b 基于java的生成、顯示、注釋RNA二級結構的軟件,可很容易地編輯、修改、生成發表質量的RNA二級結構圖。
PseudoViewer 3.0 RNA二級結構顯示軟件。
OligoEngine 2.0 RNAi設計軟件。
pknotsRG 1.3 預測RNA二級結構軟件,包括pseudoknots(假扭結)結構。
RNAshapes 2.1.6 分析RNA二級結構軟件。
miRanda 201008 查找基因組中潛在的RNA位點軟件。軟件運行需要安裝JAVA運行環境。
RNAz 2.1 預測結構保守熱穩定RNA結構,可用于基因組中篩查功能RNA結構等等。
RnaFamily java編寫的用于顯示一個RNA分子族的所有二級結構小軟件。
RNApasta 1.01 Java語言所寫的比對和結構注釋RNA序列統計分析工具。
RnaDv 1_0 RNA二級結構顯示軟件
Assemble2 1.2 構建和研究RNA結構的圖形軟件
VARNA 3-93 RNA二級結構顯示插件
nocoRNAc 1.23 非編碼RNA鑒定軟件
RnallViewer 1.0.1 RNA分析顯示軟件
  以上軟件,除特別注明外,均在生物軟件DVD光盤1中。
在線工具  
siDirect 2.0 siRNA在線設計軟件。
tRNAscan-SE 1.21 在基因組數據中尋找tRNA基因的在線工具。

 

 

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